L’Institut Pasteur de Tunis (IPT) annonce dans un communiqué de presse publié samedi 29 août 2020 qu’il organise, dans le cadre du projet européen PHINDaccess, un hackathon sur «l’Etude de la susceptibilité génétique des interactions des pathogènes humains au Covid-19 et SRAS-CoV-2.
Ce hackathon a pour objectif d’analyser des données Omiques disponibles dans les bases de données publiques du génome viral du SRAS-CoV-2 ainsi que de l’hôte humain afin d’étudier la susceptibilité génétique à la maladie dans la population tunisienne et d’étudier les interactions hôte-pathogène.
Les participants à cet événement auront la capacité à développer des pipelines de bioinformatique liés à:
-l’analyse du génome du SRAS-CoV-2 et comparaison du génome entre les souches accessibles au public ainsi que l’étude de la phylogéographie du virus et de ses voies de transmission dans le temps;
-l’analyse du génome humain et identification des variants potentiellement associés à la sensibilité au Covid-19.et appliquer ce qu’ils ont appris dans le cadre de la série de cours PHINDaccess WP2 sur des données Omiques réelles pour résoudre des questions biologiques intrigantes;
-l’identification des protéines virales et humaines impliquées dans les interactions hôte pathogène.
Ce hackathon est organisé en collaboration avec TriOMICS-CoV, un projet financé par le ministère tunisien de l’Enseignement supérieur et de la Recherche scientifique. Il est réservé aux jeunes chercheurs préalablement sélectionnés dans les laboratoires de recherche de l’IPT.
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